Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp4O70480 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms