Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Foxd2O35392 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Foxd2O35392 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Foxd2O35392 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Foxd2O35392 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Foxd2O35392 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Foxd2O35392 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Foxd2O35392 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Foxd2O35392 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Foxd2O35392 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Foxd2O35392 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Foxd2O35392 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Foxd2O35392 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms