Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms