Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pitx3O35160 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.2 ms