Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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LhbO09108 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms