Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms