Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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