Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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