Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2056J3QQ02 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms