Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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