Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lipo1J3QME6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms