Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms