Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20830J3KML6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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