Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Taf4bG5E8Z2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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