Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms