Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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