Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms