Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pagr1bF6V0H0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms