Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rdh16f1E9Q9P8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rdh16f1E9Q9P8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms