Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20518E9Q548 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm20518E9Q548 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20518E9Q548 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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