Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf2bp2E9Q1P8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms