Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms