Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd1E9PZ26 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms