Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms