Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam46aD3Z5S8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms