Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms