Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms