Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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