Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Phf11bB4XVQ1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Phf11bB4XVQ1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Phf11bB4XVQ1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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