Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4787B2RUD9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms