Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprbB2RU80 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprbB2RU80 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprbB2RU80 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprbB2RU80 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms