Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms