Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms