Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp42B2RQC2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp42B2RQC2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms