Protein–RNA interactions for Protein: B2KFW1

Zscan20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan20B2KFW1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan20B2KFW1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan20B2KFW1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms