Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spocd1B1ASB6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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