Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms