Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms