Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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AgrnA2ASQ1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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AgrnA2ASQ1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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AgrnA2ASQ1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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AgrnA2ASQ1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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AgrnA2ASQ1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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AgrnA2ASQ1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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AgrnA2ASQ1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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AgrnA2ASQ1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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AgrnA2ASQ1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AgrnA2ASQ1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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