Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn3aA2ASI5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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