Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Rtf1A2AQ19 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rtf1A2AQ19 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rtf1A2AQ19 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtf1A2AQ19 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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