Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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