Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ttll9A2APC3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttll9A2APC3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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