Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabreA2AMW3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms