Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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