Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms