Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms