Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm42737-201ENSMUST00000201074 1755 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms