Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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