Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Mrpl40Q9Z2Q5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Mrpl40Q9Z2Q5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms